Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms