Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Amigo1Q80ZD8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Amigo1Q80ZD8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Amigo1Q80ZD8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Amigo1Q80ZD8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Amigo1Q80ZD8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Amigo1Q80ZD8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Amigo1Q80ZD8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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