Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Pkhd1l1Q80ZA4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Pkhd1l1Q80ZA4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Pkhd1l1Q80ZA4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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