Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lrrc27Q80YS5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms