Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alkbh8Q80Y20 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alkbh8Q80Y20 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms