Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc28Q80XJ3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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