Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Pcsk9Q80W65 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pcsk9Q80W65 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Pcsk9Q80W65 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Pcsk9Q80W65 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Pcsk9Q80W65 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pcsk9Q80W65 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pcsk9Q80W65 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pcsk9Q80W65 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pcsk9Q80W65 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pcsk9Q80W65 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pcsk9Q80W65 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pcsk9Q80W65 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms