Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Aldh3b1Q80VQ0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Aldh3b1Q80VQ0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms