Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Avl9Q80U56 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Avl9Q80U56 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms