Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Dsg1cQ7TSF0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms