Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Actn1Q7TPR4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Actn1Q7TPR4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms