Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prrc2bQ7TPM1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prrc2bQ7TPM1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms