Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TwistnbQ78WZ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TwistnbQ78WZ7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms