Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cd3eapQ76KJ5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cd3eapQ76KJ5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms