Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Syne2Q6ZWQ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms