Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp34Q6ZQ93 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Usp34Q6ZQ93 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms