Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Glis3Q6XP49 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Glis3Q6XP49 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms