Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pcp4l1Q6W8Q3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pcp4l1Q6W8Q3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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