Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms