Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Med16Q6PGF3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms