Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim45Q6PFY8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim45Q6PFY8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms