Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PdgfrlQ6PE55 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms