Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Taf1cQ6PDZ2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms