Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc85bQ6PDY0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc85bQ6PDY0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms