Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sarm1Q6PDS3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sarm1Q6PDS3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms