Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SvoplQ6PDF3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvoplQ6PDF3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms