Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mfsd13aQ6PDE8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms