Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6PD19 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6PD19 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q6PD19 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q6PD19 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q6PD19 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q6PD19 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q6PD19 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Q6PD19 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q6PD19 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q6PD19 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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