Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Herc4Q6PAV2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms