Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atl2Q6PA06 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms