Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx6Q6P8X1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx6Q6P8X1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms