Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms