Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E1

Zmiz1, Zinc finger MIZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz1Q6P1E1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zmiz1Q6P1E1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zmiz1Q6P1E1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms