Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cpsf6Q6NVF9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms