Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HelbQ6NVF4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms