Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CltbQ6IRU5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CltbQ6IRU5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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