Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Krt39Q6IFX4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt39Q6IFX4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms