Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KdsrQ6GV12 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KdsrQ6GV12 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KdsrQ6GV12 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KdsrQ6GV12 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KdsrQ6GV12 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KdsrQ6GV12 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KdsrQ6GV12 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KdsrQ6GV12 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms