Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Smarca2Q6DIC0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Smarca2Q6DIC0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms