Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp7Q6A4J8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms