Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rftn1Q6A0D4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rftn1Q6A0D4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms