Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
N4bp1Q6A037 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms