Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pdzrn3Q69ZS0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pdzrn3Q69ZS0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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