Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PnkdQ69ZP3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PnkdQ69ZP3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms