Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fgd6Q69ZL1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms