Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cntn4Q69Z26 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cntn4Q69Z26 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms