Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Irf4Q64287 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Irf4Q64287 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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