Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sf1Q64213 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sf1Q64213 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms