Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Polr2kQ63871 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms