Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ift52Q62559 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms